La colaboraci\u00f3n con el CIDETIC en la interdisciplina Bioinform\u00e1tica surge a partir de un proyecto de articulaci\u00f3n con el Centro de Investigaci\u00f3n, Docencia y Extensi\u00f3n (PI – CIDE) de la convocatoria 2019.<\/p>\n\n\n\n
Resumen del Proyecto<\/strong><\/p>\n\n\n\n Las nuevas tecnolog\u00edas de secuenciaci\u00f3n masiva de \u00e1cidos nucleicos, y su consecuente disminuci\u00f3n en el costo, han permitido que la investigaci\u00f3n en el \u00e1rea de la gen\u00f3mica y la transcript\u00f3mica tenga mayor alcance, demandando a su vez investigadores en la interdisciplina bioinform\u00e1tica. RNA-Seq es una herramienta muy utilizada para el estudio de transcriptomas, especialmente de organismos no modelo, como son las plantas medicinales. El estudio del transcriptoma brinda informaci\u00f3n acerca de la expresi\u00f3n de genes de un tejido espec\u00edfico bajo una determinada condici\u00f3n. Sin embargo, la versi\u00f3n del transcriptoma obtenido puede ser muy variable dependiendo de las herramientas utilizadas en el procesamiento del producto de la secuenciaci\u00f3n. El objetivo de este proyecto es investigar las herramientas de procesamiento (limpieza de reads y ensamblado de novo) mediante su aplicaci\u00f3n en datos de RNA-Seq de especies de plantas medicinales, con el fin de obtener un transcriptoma de cada especie que oficie como secuencia de referencia.<\/p>\n\n\n\n Integrantes del Grupo de Investigaci\u00f3n:<\/strong><\/p>\n\n\n\n Directores:<\/p>\n\n\n\n Integrantes investigadores Integrantes estudiantes<\/p>\n\n\n\n Resultados<\/strong><\/p>\n\n\n\n Como resultado de este proyecto, dos estudiantes hicieron su tesina para optar por el t\u00edtulo de grado:<\/p>\n\n\n\n Estudiante: Claudia P. Reinaudi Estudiante: Juli\u00e1n Maggio Adem\u00e1s el estudiante Juli\u00e1n Maggio, que actualmente es doctorando del Programa de Doctorado en Cs Aplicadas de la UNLu en un tema que tiene como eje central la Bioinform\u00e1tica, como estudiante tuvo una beca EVC \u2013 CIN (2020) de inicio a la Investigaci\u00f3n.<\/p>\n\n\n\n Durante el desarrollo del proyecto se avanz\u00f3 en la realizaci\u00f3n de un Convenio de Cooperaci\u00f3n T\u00e9cnica entre la Universidad Nacional de Luj\u00e1n a trav\u00e9s del CIDETIC y el Instituto Nacional de Tecnolog\u00eda Agropecuaria a trav\u00e9s del Instituto de Recursos Biol\u00f3gicos del Centro de Investigaci\u00f3n en Recursos Naturales (RESHCS-LUJ: 223-21) (ya terminado) que di\u00f3 el marco para la vinculaci\u00f3n entre el Lic. Alexander Rivero y el CIDETIC que involucra la utilizaci\u00f3n de los recursos f\u00edsicos y el uso de herramientas de Bioinform\u00e1tica, muchas de ellas implementadas durante el proyecto. Esa colaboraci\u00f3n ya est\u00e1 finalizada. <\/p>\n\n\n\n En la l\u00ednea que se ven\u00eda trabajando decidimos presentarnos a la convocatoria PICT-UNLu 2021 obteniendo un subsidio que nos permiti\u00f3 obtener productos de secuenciaci\u00f3n propios y continuar fortaleciendo la pr\u00e1ctica y ense\u00f1anza de t\u00e9cnicas de Bioinform\u00e1tica para el an\u00e1lisis de datos gen\u00f3micos.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":" La colaboraci\u00f3n con el CIDETIC en la interdisciplina Bioinform\u00e1tica surge a partir de un proyecto de articulaci\u00f3n con el Centro de Investigaci\u00f3n, Docencia y Extensi\u00f3n (PI – CIDE) de la convocatoria 2019. Resumen del Proyecto Las nuevas tecnolog\u00edas de secuenciaci\u00f3n masiva de \u00e1cidos nucleicos, y su consecuente disminuci\u00f3n en el costo, han permitido que la […]<\/p>","protected":false},"author":5,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"categories":[22],"tags":[],"class_list":["post-985","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-bioinformatica"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/985","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/5"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=985"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/985\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":990,"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/985\/revisions\/990"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=985"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=985"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/cidetic.unlu.edu.ar\/en\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=985"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}\n
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T\u00edtulo: \u201cEficiencia en el ensamblado De Novo de secuencias de RNA-Seq. Estudio de la performance de algoritmos.\u201d
Directora: Dra. Ing. Agr. Sabrina Costa T\u00e1rtara
Co-director: Dr. Lic. en Sistemas de Informaci\u00f3n Gabriel Tolosa
Fecha de defensa: 02\/10\/2020
Calificaci\u00f3n: 10 (diez).<\/p>\n\n\n\n\n
<\/ol>\n\n\n\n
T\u00edtulo: \u201cEvaluaci\u00f3n de ensamblados de RNA-Seq de Manzanilla (Matricaria chamomilla<\/em>) para la definici\u00f3n de un flujo de trabajo en la construcci\u00f3n de transcriptomas de Novo.\u201d
Directora: Dra. Ing. Agr. Sabrina Costa T\u00e1rtara
Co-directora: Dra. Laura Garc\u00eda (IBAM-CONICET, Mendoza).<\/p>\n\n\n\n