En el año 2022, a partir del ingreso a CONICET, se inició una línea de investigación que se encuentra actualmente en curso titulada: “Integración de datos biológicos de alta dimensionalidad para su aplicación en el uso de Recursos Genéticos Vegetales Nativos”.
Esta línea se enmarca en el perfil de I+D+i (Investigación, Desarrollo e Innovación) establecido por el Departamento de Ciencias Básicas en 2020 para el Ingreso a Carrera del Investigador Científico del CONICET.
Equipo de Trabajo
- Director: Dr. Guillermo Raúl Pratta (IICAR, CONICET-UNR)
- Co-director: Dr. Gabriel Tolosa (UNLu)
- Investigadora: Dra. Sabrina Costa Tártara
Resumen de la Investigación
El análisis de bases de datos de alta dimensionalidad, en sus diferentes enfoques, permite lograr una mayor eficiencia en la prospección y uso de los Recursos Fitogenéticos para la Alimentación y la Agricultura, y sus parientes silvestres. En la actualidad el volumen de los datos generados crece continuamente, por lo que la generación de grandes bases de datos y metodologías para su análisis es un área de vacancia con alto impacto en diferentes ramas del conocimiento, y un activo de altísimo valor para una sociedad. En el área de las Ómicas, el progreso de técnicas de alto rendimiento para la generación de datos masivos presenta un escenario complejo y multidireccional para la generación de información, y se encuadra en las propiedades que se han propuesto para caracterizar un problema como Big Data.
La propuesta metodológica se presenta tomando como modelo la quínoa o quinua (Chenopodium quinoa), un pseudocereal con alto potencial tanto desde sus bondades nutritivas como de su versatilidad agronómica, para contribuir a la seguridad alimentaria a nivel global, y cuyos recursos genómicos están en pleno desarrollo. Los objetivos específicos se basan en la exploración y explotación de bases de datos masivas de acceso público para la identificación de genes de interés, y a mayor detalle caracterizar su polimorfismo. Se propone la aplicación de análisis multivariado a tres modos para generación de información integrada sobre las OTUs que presenten ésta condición y el desarrollo de pipelines de trabajo. Se espera contribuir al uso sostenible de los recursos genéticos como base biológica y materia prima esencial para el fitomejoramiento, a través de la producción de conocimiento aprovechable, en primera instancia, para el ámbito nacional.
La línea se enmarca en el perfil de I+D+i (Investigación, Desarrollo e Innovación) establecido por el Departamento de Cs Básicas en 2020 para el Ingreso a Carrera del Investigador Científico del CONICET.
Producción Científica
A partir del ingreso a CONICET y la ejecución de la línea de trabajo se dió lugar a numerosos resúmenes presentados en congresos en los años 2022, 2023, 2024 y 2025, coronando en una publicación en el ámbito internacional en el año 2026 titulada: Integrated In Silico Characterization of Quinoa Hsp20 Genes Reveals Preferential Responsiveness to Drought and Salinity over Heat Stress.
El Rol del CIDETIC
En dicha publicación se agradece al CIDETIC en la última parte.
El hecho de trabajar con datos biológicos que representan diferentes niveles de la fisiología de una célula (datos ómicos) hace necesario tener capacidad de procesamiento de muchos Gigabases de datos y es por eso que el uso de los servidores y el cluster del CIDETIC se hace imprescindible. Sin la factibilidad de hardware que ofrece el CIDETIC no sería posible, y lo que es más importante tampoco promover su enseñanza y entrenamiento en estudiantes que serán futuros profesionales en las áreas de Biología molecular o Sistemas de Información.
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